Будущий исповедник Алексей Лукич Кононский родился в 1884 г. в городе Сквира Киевской губернии в семье мещанина.

Монашеский постриг принял 17 марта 1923 г.

В 1897 г. окончил Киево-Шулявскую церковно­приходскую школу. С 17 июня 1907 г. — в чис­ле трудящихся лаврской странноприимницы, с июля — послушник. Затем несет послушание в серебряной мастерской. 19 декабря 1914 г. об­лачен в рясофор наместником Лавры архиман­дритом Амвросием. В дальнейшем выполняет по­слушание в благочинническом ведомстве. 11 мая 1918 г. назначен чтецом церкви Больничного монастыря, затем нес клиросное послушание на Ближних пещерах, в странноприимнице, Свято-Преображенской пустыни и др.

С 1919 г. — на клиросе Дальних пещер, а также до 1922 г. несет миссионерское послушание. По­стриг в мантию совершен в церкви прп. Феодо­сия на Дальних пещерах. 16 декабря 1923 г. в Ве­ликой церкви рукоположен в сан иеродиакона. После выселения из Лавры в конце 1920-х гг. жил на ул. Арсенальной, 19, и в Крестовом пере­улке, 1. Служил в Александро-Невской церкви на Печерске. Занимался поденной работой, пилил дрова. В 1928 г. некоторое время был на приходе в одном из сел Киевской области.

В 1928 г. среди православных в Киеве распростра­нялась брошюра под названием «А. Затворник. Обновленцы по суду канонов Вселенской Право­славной Церкви» (объем 125 стр.). Из лаврских монахов ее приобрели иеродиакон Иннокентий (Логвинов), иеромонахи Филогоний (Неделько, умер в декабре 1928 г.), Николай (Козорезов), Еразм (Прокопенко), Иеремия (Оленич) и др. Брошюра была обнаружена в Полтаве и других на­селенных пунктах.

В связи с распространением брошюры о. Апол­лоний арестован органами ГПУ 31 января 1929 г. по постановлению о привлечении 5 человек в качестве обвиняемых «за изготовление, хранение и распространение антисоветской, контррево­люционной литературы и использование религиозных предрассудков масс». Решением Особого совещания при коллегии ОГПУ от 31 мая 1929 г. о. Аполлоний осужден на 3 года трудлагерей. В числе 5 осужденных был также священник церк­ви с. Позняки Смолий Никита Антонович. 6 июня 1929 г. поступает срочное указание ГПУ: осужден­ных «надлежит отправить в Соловки».

По свидетельским показаниям 1939 г., о. Аполлоний после ссылки вернулся в 1932 г. в Украину и «прекратил всякую деятельность».